Advances in Clinical Medicine
Vol.06 No.01(2016), Article ID:17157,5
pages
10.12677/ACM.2016.61009
Research of PCDH10 DNA Methylation in Gastric Cancer
Yafei Ju1, Xiangjun Jiang2*
1Spleen-Stomach Disease Department, Yanzhou Traditional Medicine Hospital, Jining Shandong
2Gastroenterology Department, Qingdao Municipal Hospital, Qingdao Shandong
Received: Feb. 25th, 2016; accepted: Mar. 13th, 2016; published: Mar. 17th, 2016
Copyright © 2016 by authors and Hans Publishers Inc.
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ABSTRACT
Objective: To analyze and compare methylation status of PCDH10 gene in gastric cancer and nomal tissues. Methods: Methylation-Specific PCR (MSP) and RT-PCR (real-time RT-PCR) were applied to detect DNA methylation features of the PCDH10 gene in 100 smples. Results: The PCDH10 gene methylation in the gastric cancer tissues was significantly higher than that in normal tissues. Conclusion: PCDH10 DNA methylation is correlated with gastric cancer.
Keywords:PCDH10, MSP, RT-PCR, Gastric Cancer
PCDH10基因DNA甲基化在胃癌中的研究
鞠亚菲1,姜相君2*
1山东省济宁市兖州区中医医院脾胃病科,山东 济宁
2青岛市市立医院消化内科,山东 青岛
收稿日期:2016年2月25日;录用日期:2016年3月13日;发布日期:2016年3月17日
摘 要
目的:探讨PCDH10(原钙粘蛋白10)基因DNA发生甲基化后,其表达与胃癌发生的关系。方法:采用甲基化特异性PCR (methy-lation specific PCR)法和实时荧光定量逆转录–多聚合酶链反应(real-time RT-PCR)方法检测100例胃癌组织及正常组织中PCDH10基因启动子区的甲基化情况。结果:胃癌组织中PCDH10基因的甲基化阳性率较正常组织明显升高,差异具有统计学意义。结论:PCDH10的基因DNA甲基化可能与胃癌发生有关。
关键词 :原钙粘蛋白10,甲基化特异性聚合酶链反应,实时荧光定量逆转录–多聚合酶链反应,胃癌
1. 引言
胃癌是常见的消化道恶性肿瘤,发病机制复杂,其发生发展与特定基因DNA甲基化状态改变密切相关。DNA甲基化是化是目前表观遗传学中的研究热点,特定基因DNA的甲基化与胃癌的发生发展,诊断治疗及预后密切相关。近年来,越来越多的研究结果显示原钙粘蛋白10 (PCDH10)的表达缺失与胃癌,结直肠癌及肝癌密切相关。本文拟通过对比胃癌组织与正常组织中PCDH10启动子区的甲基化情况,初步探讨PCDH10的表达缺失与胃癌的发病关系。
2. 资料与方法
2.1. 对象及分组
收集青岛大学医学院附属青岛市市立医院普外科2014年1月~2015年1月手术切除的胃癌肿瘤标本100例,标本均经病理科复核并确诊为原发性胃癌,其中男50例,女50例,平均年龄53.76岁 ± 11.89岁。
2.2. 标本搜集及储存
胃癌组织取自癌灶中央非坏死区域,正常组织取自与之配对的距离癌组织5 cm以上区域,取后立即置于RNA保存液中,−80℃冰箱保存,用于提取DNA和RNA,入选患者术中均行淋巴结清扫,术前未行放化疗,拥有完整的临床资料。
2.3. 检测指标及方法
组织DNA提取严格按照离心柱试剂盒(北京天根)操作说明书进行,保证提取的DNA无蛋白质及RNA污染。对DNA修饰后进行甲基化特异性PCR (methy-lation specific PCR),提取RNA采用日本TakaRa公司的RNA提取试剂盒,提取后的RNA逆转录为cDNA保存于−20℃冰箱中,以进行RT-PCR反应。反应引物为PCDH10-F (bp120-GGCAAGTAACGGTGGAGATG.PCDH10-R(bp228C)-TCTCCGGATGGA TGTTCTTC (Invitrogen英潍捷基上海贸易有限公司)。
2.4. 统计学处理
应用SPSS17.0软件包进行统计学处理,计数资料比较采用χ2检验,P为双侧性检验,P < 0.05认为差异有统计学意义。
3. 结果
胃癌组织与正常组织中PCDH10启动子区的甲基化情况:胃癌组织中启动子区甲基化率为46.00% (46/100),明显高于正常组织12% (12/100),差异有统计学意义(χ2 = 21.04, P < 0.05)。PCDH10扩增曲线熔解曲线见图1,熔解曲线见图2。在胃癌组织中,PCDH10基因启动子区域的DNA甲基化导致了其基因表达缺失,PCDH10基因的甲基化状态与胃癌的发生有密切关系。
Figure 1. PCDH10 amplification curve
图1. PCDH10扩增曲线
Figure 2. PCDH10 dissociation curve
图2. PCDH10熔解曲线
4. 讨论
DNA甲基化是对DNA的一种化学修饰,主要发生于胞嘧啶 [1] [2] ,通过甲基转移酶(DNA methyltransferance, DNMT)来实现 [3] [4] 。首先,DNMT与DNA结合,将目标核苷酸反转暴露于DNA双螺旋外,之后半胱氨酸的亲和基团与胞嘧啶第六位碳C6共价结合,从S-腺苷甲硫氨酸SAM处转甲基至胞嘧啶C5 [5] 上,从而形成甲基化状态。目前已有许多研究报道这两种之间的关系。Lou J [6] 和Fang JY [7] 等发现在胃癌组织中c-myc和c-Ha-ras基因甲基化水平降低,c-Ha-ras基因低甲基化是胃腺细胞早期癌变的一个重要遗传学事件。以往研究也证实了参与调节细胞周期的p14,p15,p16,CHF,RIZI基因,介导细胞信号转导的APC,PTEN,RASSF1,RUNX3,PDK1基因;参与DNA修复的hMLH1,MGMT,pS2基因及抑制肿瘤扩散生长和转移的E-cadherin,TIMP-3基因存在高甲基化。
PCDH10 (原钙粘蛋白10)是钙粘蛋白超家族成员,其4q28.3染色体区域在肝癌,结直肠癌,前列腺癌,胰腺癌和乳腺癌中存在缺失。目前研究的热点集中于中枢神经系统方面,在消化道肿瘤方面的研究较少。Zhong X等 [8] 研究发现在8个结直肠癌细胞系中PCDH10基因启动子区DNA均表达沉默。Fang S等 [9] 研究了PCDH10基因DNA发生甲基化后,在肝癌中的表达下降,并发现该基因可作为肝癌的筛查基因之一。Li Z等 [10] 发现在人胃癌组织中,PCDH10表达量明显下降,且灵敏度较高,可作为筛查早期胃癌的靶点之一。Yu B等人 [11] 运用高分辨率熔解曲线技术对100例胃癌,100例结直肠癌及70例胰腺癌组织中的PCDH10基因DNA甲基化水平进行检测,发现其甲基化水平与肿瘤的发生密切相关。Yu J等人 [12] 研究发现PCDH10作为一个肿瘤抑制基因,与胃癌的不良预后有极为密切的关系。
本实验表明,在胃癌组织中,PCDH10基因启动子区域的DNA甲基化导致了其基因表达缺失,PCDH10基因的甲基化状态与胃癌的发生有密切关系,更深层次的研究需在大样本的条件下进一步深入。
基金项目
青岛市科技局基金资助项目,No.
文章引用
鞠亚菲,姜相君. PCDH10基因DNA甲基化在胃癌中的研究
Research of PCDH10 DNA Methylation in Gastric Cancer[J]. 临床医学进展, 2016, 06(01): 45-49. http://dx.doi.org/10.12677/ACM.2016.61009
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*通讯作者。