Hans Journal of Biomedicine 生物医学, 2013, 3, 12-16 http://dx.doi.org/10.12677/hjbm.2013.32003 Published Online April 2013 (http://www.hanspub.org/journal/hjbm.html) D-Serine and Serine Racemase* Yanqiong Feng1, Hong Xiao2, Yawei Shi1# 1Key Laboratory of Chemical Biology and Molecular Engineering of Education Ministry, Institute of Biotechnology, Shanxi University, Taiyuan 2Department of Pathology, The First Hospital, Shanxi Medical University, Taiyuan Email: fengyanqiong6112@163.com, xiaohh9999@yahoo.com.cn, #yaweishi@sxu.edu.cn Received: Mar. 18th, 2013; revised: Mar. 25th, 2013; accepted: Apr. 20th, 2013 Copyright © 2013 Yanqiong Feng et al. This is an open access article distributed under the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited. Abstract: D-serine mainly distributed in the mammalian forebrain, hippocampus and striatum, which as neurotransmit- ters from glial cells, target at NMDA receptors, and cause central nervous system signal transduction. A new neuro- transmitter of D-serine is found playing an important role in synaptic plasticity, learning and memory. Serine racemase (SR) is a pyridoxal 5'-phosphate(PLP)-dependent enzyme that catalyzes the interconversion of L- and D-serine. Serine racemase may be a new target for the neurological and psychiatric diseases. In this review, the recent advances in D-serine and serine racemase with the aspects of structure, function, mechanism and regulation will be discussed. Keywords: Serine Racemase; D-Serine; Structure; Function; Mechanism; Regulation D-丝氨酸与丝氨酸消旋酶* 冯延琼 1,肖 虹2,石亚伟 1# 1山西大学生物技术研究所,教育部化学生物学与分子工程重点实验室,太原 2山西医科大学第一医院病理科,太原 Email: fengyanqiong6112@163.com, xiaohh9999@yahoo.com.cn, #yaweishi@sxu.edu.cn 收稿日期:2013 年3月18 日;修回日期:2013年3月25日;录用日期:2013 年4月20 日 摘 要:D-丝氨酸主要存在于哺乳动物的前脑,海马区和纹状体,作为胶质细胞释放的神经递质,作用于NMDA (N-methyl-D-aspartate receptor)受体,引起中枢神经系统中信号的传导。在突触可塑性,学习和记忆等方面起重 要作用。丝氨酸消旋酶是一种磷酸吡多醛依赖酶,在AT P和Mg2+的辅助下,通过消旋作用将 L型丝氨酸转变 为D型丝氨酸。对于神经及精神性疾病,丝氨酸消旋酶可能是一个新的治疗靶点。本文从 D-丝氨酸和丝氨酸消 旋酶的结构性质,作用机理,功能,调控等方面进行了阐述。 关键词:丝氨酸消旋酶;D-丝氨酸;结构;机理;功能;调控 1. 引言 D-丝氨酸首先在真核生物被发现,包括蚯蚓,蚕 以及其他鳞翅目昆虫中。随着气相色谱和质谱分析应 用于手性氨基酸检测和分离,人们发现在哺乳动物神 经系统中也存在区域性的高浓度内源性的 D-丝氨酸 [1]。D-丝氨酸主要存在于哺乳动物脑内灰质区中的Ⅱ 型星形胶质细胞内,这种胶质细胞多位于突触旁边 [2,3]。在脑部 D-丝氨酸主要分布在前脑区,如海马区, 纹状体和前额叶皮层,而在其余外围组织分布得很少 [4]。D-丝氨酸不同于其它神经元来源的神经递质,作 为一种新的神经胶质细胞递质,在神经胶质和神经元 *基金项目:国家自然基金(30400065)。 #通讯作者。 Copyright © 2013 Hanspub 12 D-丝氨酸与丝氨酸消旋酶 传递过程中起着关键的作用[5,6]。 2. 丝氨酸消旋酶的结构及性质 在哺乳动物体内富含D-丝氨酸的中枢神经系统 中同时发现了丝氨酸消旋酶(Serine Racemase) (EC 5.1.1.18),该酶的发现为内源性D-丝氨酸的产生提供 了很好的解释。丝氨酸消旋酶属于Ⅱ型 5'-磷酸吡哆醛 酶系,结构类似于细菌的丝/苏氨酸水解酶,在ATP 和Mg2+的辅助下,通过外消旋作用将L-丝氨酸转变 为D-丝氨酸,同时产生硫,氨和丙酮酸盐[7]。Wolosker 等通过数据库分析克隆了人的丝氨酸消旋酶,其 cDNA 全长 1020 个核苷,编码340 个氨基酸,通过与 老鼠丝氨酸消旋酶的序列分析,同源性高达 88% 。 Northern-blot 分析表明丝氨酸消旋酶主要分布在前 脑,在海马区和纹状体处表达量很高,这与D-丝氨酸 以及 NMDA 受体的分布相一致。染色体定位揭示, 丝氨酸消旋酶位于 17 号染色体长臂的 13.3 处,包含 7个外显子[8]。随后从鼠脑中分离纯化了丝氨酸消旋 酶,分子量为37KD。丝氨酸消旋酶是一种保守酶, 活性较低,对底物 L-丝氨酸有高度选择性。酶的最适 pH 值为 8~9,最适温度为 37℃。丝氨酸消旋酶保持 酶活需要 5'-磷酸吡哆醛(PLP),如果去除了 PLP,酶 活丧失,若添加PLP 又会恢复酶活[9]。 以丝氨酸消旋酶晶体结构为依据,建立了它的二 聚体模型。同时研究表明它存在一些活性部位:PLP 结合位点,二价阳离子结合位点,核苷结合位点及蛋 白相互作用位点等[10,11](图1)。 3. 丝氨酸消旋酶的催化机理 丝氨酸消旋酶是二聚体,单体的丝氨酸消旋酶有 两个结构域,一个大的结构域和一个小的结构域,大 的结构域包含可与 PLP 结合的区域和参与形成二聚 体区域[12]。当丝氨酸消旋酶结合ATP 和Mg2+,催化 L-丝氨酸转变为D-丝氨酸时,酶的构象发生改变,从 松弛状态到紧缩状态。这种结构域的变化使得大小两 个结构域重新定位,因此小的结构域可能重新定位为 催化位点,因而使得关键位点 Ser84更有利与底物的 结合[13]。 丝氨酸消旋酶的催化反应包括消旋作用和底物 氨基酸 α,β位点的脱氢过程,然后产生对应底物构型 正好相反的氨基酸,反应中产生稳定带负电荷的中间 物。消旋反应在L-丝氨酸和PLP 之间形成了一个醛亚 胺中间物(反应 1),接着Lys56 提取了 α位点的质子(反 应2)形成了一个稳定的碳负离子中间物[14]。在消旋反 应中,在碳负离子中间物的对面质子化作用形成 D- 丝氨酸(反应 3和4)。目前的结构研究证明了这种模 式,质子的提取和再质子化是由Lys56和Ser84来完 成的,丝氨酸消旋酶催化反应类似于丙氨酸消旋酶 [12,13,15,16]。在去质子的反应中,α,β位点的去质子过程 是由底物的 β-羟基去质子来完成的(反应 5),然后脱 水(反应 6)接着形成了一种不稳定的氨酰中间物,接着 酰自发的水解形成丙酮酸盐和 NH4+(反应 7)(图2)。 氨 Figure 1. 3D Model of the dimeric serine racemase. The relative position of the PLP (red sticks), Ca2+ (magenta spheres) and AMP p c p (or- ange sticks) are shown. The N- and C-terminal ends of hSR are indicated a s N and C, respectively 图1. 丝氨酸消旋酶的二聚体结构。红色是 PLP 结合位点,洋红色是 Ca2+结合位点,橘红色是 AMP 结合位点 Copyright © 2013 Hanspub 13 D-丝氨酸与丝氨酸消旋酶 Figure 2. Proposed catalytic cycle of serine racemase 图2. 丝氨酸消旋酶的催化机理 4. D-丝氨酸的生物学功能 4.1. D-丝氨酸激活 NMDA受体的 甘氨酸结合位点 NMDA受体是 哺乳动物中枢神经系统 内一类重 要的兴奋性氨基酸受体。它在突触可塑性,学习和记 忆等生理过程,以及癫痫、精神病等病理过程中发挥着 重要的作用。该受体上存在 Gly和Glu 结合位点,它 的活化需要 Gly和Glu 位点的共激活[17]。多个研究小 组已经证明由丝氨酸消旋酶产生的D-丝氨酸可作用 于NMDA受体上的 Gly结合位点,通过与 Gly 位点 的高亲和力结合对 NMDA 受体的功能进行调控,从 而影响其生理或病理过程[2,18-20]。生理过程主要体现 在NMDA 的传导,突触的可塑性以及脑细胞发育过 程中的细胞转移等;病理过程主要表现在当D-丝氨酸 不能对 NMDA受体起到充分的调节作用时,就会引 起NMDA 受体功能紊乱,引发一些病理过程,如神 经精神疾病,衰老,神经恶化性疾病等[21,22]。 4.2. D-丝氨酸参与学习和记忆 神经元突触的活动修饰而产生的可塑性被认为 是产生学习和记忆的细胞机制。由于海马的长时程增 强(LTP)是依赖于 NMDA 受体的激活,而D-丝氨酸是 NMDA 受体的内源性配体,表明星形胶质细胞释放的 D-丝氨酸与 CA1 区锥体细胞的 LTP 的诱导有关。有 报道表明丝氨酸消旋酶对 NMDA 受体应答和 LTP 是 必须的,研究中使用缺失丝氨酸消旋酶的小鼠表现为 NMDA受体活性降低而引起的行为性损伤和一定空 间的学习性缺乏[23],给予 D-丝氨酸表现出了改善学习 记忆功能的作用。另外,D-丝氨酸改善 D-氨基酸氧化 酶对 LTP 的抑制作用[24]。 4.3. D-丝氨酸在神经及精神性疾病治疗中 的作用 D-丝氨酸不仅对神经递质的传统观念提出了挑 战,而且作为 NMDA 受体的内源性配体,为NMDA 受体过度兴奋或者功能抑制所导致的神经系统疾病 提供了新的研究方向。目前的观点认为,直接补充 D-丝氨酸可以改善 NMDA受体功能低下所致的神经 递质传递紊乱,而对于那些NMDA 受体过度兴奋引 发兴奋性神经毒性反应的疾病,丝氨酸消旋酶可能是 一个新的治疗靶点[25]。 5. 丝氨酸消旋酶的调控 5.1. 丝氨酸消旋酶被钙、镁等二价阳离子 和ATP 激活 钙、镁、锰等二价阳离子和ATP 均可独立地激活 丝氨酸消旋酶[26]。二价阳离子是通过保持丝氨酸消旋 酶的稳定性来提高酶的催化效率的。丝氨酸消旋酶 中,参与钙结合的残基涉及到 Glu210、Asp216 和 Ala214,这三个残基在植物和酵母丝氨酸消旋酶中都 是保守的。但是二价阳离子对酶的激活作用是有限 的,当有 EDTA 存在时会降低酶的催化活性,而 ATP Copyright © 2013 Hanspub 14 D-丝氨酸与丝氨酸消旋酶 仍能增大酶的催化性能,但不会参与酶构象的改变和 动力学反应。当有 100 µM ATP时,酶的最大反应速 率会增大 2.2倍,但是米氏常数不变。另外,ATP 在 催化过程中不会被水解,细胞内ATP 的含量远高于活 化丝氨酸消旋酶所需要的量,因此推断ATP 可能在体 内起其他的作用[27]。 5.2. D-丝氨酸消旋酶被谷氨酸受体相互作用 蛋白(GRIP)的PDZ 结构域激活 GRIP包含 4个PDZ 结构域,PDZ6 与丝氨酸消 旋酶 C末端结构特异结合,PDZ4 和PDZ5 与AMPA 通道结合[28]。还有两个未知功能的 GAP结构域。 但是丝氨酸消旋酶仅与 GRIP 的PDZ6结构域结 合并不能被活化,全长的 GRIP 或者含有 PDZ4- PDZ5-PDZ6-GAP2-PDZ7 的结构域才能增加酶活。丝 氨酸消旋酶与GRIP 结合后,酶的最大反应速率和米 氏常数都会发生改变。因此推断GRIP 的结合引起了 丝氨酸消旋酶构象改变从而被激活[12]。另外,与GRIP 结合的丝氨酸消旋酶对钙离子的应答曲线不变,这表 明,GRIP的结合与钙离子的调节是两条相对独立的 路径。丝氨酸消旋酶,GRIP 和AMPA 的GluR2 亚基 形成的三元复合物可能使得丝氨酸消旋酶与钙离子 通道接近。PICK1 含有一个 PDZ结构域,它与 PKC 以及丝氨酸消旋酶的相互作用有关[29,30]。但是还没有 研究说明 PICK1 结合后对于丝氨酸消旋酶活性的影 响,目前只是推测 PICK1 与PKC 的相互作用导致瞬 时引起了丝氨酸消旋酶的磷酸化[31]。 5.3. D-丝氨酸消旋酶活性的反馈调节 在胶质细胞中丝氨酸消旋酶催化产生 D-丝氨酸, 作用于 NMDA受体,引起钙通道的激活而使钙离子 进入突触后神经元,接着 NO合成酶激活而释放 NO, 丝氨酸消旋酶随之被亚硝基化而受到抑制[32]。 另外,NMDA受体激活后可以使丝氨酸消旋酶从 细胞质中转移到细胞膜上,细胞膜上的 PIP2 通过竞 争性的结合 ATP 来抑制丝氨酸消旋酶的活性,减少 D-丝氨酸的生成。这是一种反馈抑制机理,从而防止 NMDA 受体过度活化[33]。 6. 展望 丝氨酸消旋酶存在于哺乳动物中枢神经系统中, 转化 L-丝氨酸为 D-丝氨酸。D-丝氨酸与甘氨酸共同 作用于 NMDA受体,引起中枢神经系统中信号的传 导。科学家在丝氨酸消旋酶的结构及作用机制研究的 基础上,进一步对其抑制剂展开研究。目前,最有好 的丝氨酸消旋酶抑制剂是L-erythro-3-hydroxyaspar- tate,类似于底物 L-丝氨酸[34]。总之,D-丝氨酸消旋 酶可为临床上治疗 NMDA 受体过度活化引起的神经 及精神疾病提供了一种新的作用靶点,为人类的健康 带来福音。 参考文献 (References) [1] N. Fujii. D-amino acids in living higher organisms. Origins of Life and Evolution of Biospheres, 2002, 32(2): 103-127. [2] M. J. Schell, M. E. Molliver and S. H. Snyder. D-serine, an endogenus synaptic modulator: Localization to astrocytes and glutamate-stimulated release. Proceedings of National Academy Science USA, 1995, 92(9): 3948-3952. [3] M. J. Schell, R. O. Brady Jr, M. E. Molliver, et al. 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